Ishiya et al. 2026 — два високопокривних геноми Японії

Два геноми, які розводять «субстрат» на дві різні речі. IY1 — ранній Дзьомон (~8.2–8.3 тис. р. т.), майже без спорідненості з материковою Азією. DO — середній Яйой (~2.3 тис. р. т.), тісно пов’язаний із Північно-Східною Азією (Монгольське плато, Шаньдун). Плюс несподіванка: AMY1 (крохмальна амілаза) у мисливця-збирача Дзьомон — ~9 копій, тобто адаптація до крохмалистої їжі склалася за тисячоліття до рису. Це прямий тест розрізняльника «відбір проти індукції» з Zustrichna_koevolyutsiia_lyudyny_i_sviiskykh_tvaryn §IV.3 — і він знову дає відбір.

Ishiya K. та ін. High-coverage ancient genomes reveal divergent population histories and prehistoric starch-related genetic variation in Japan. — PNAS (2026), doi:10.1073/pnas.2606162123; PMID 42490385. Керівник — Кодзі Ішія, Інститут вивчення стародавніх цивілізацій, Університет Каназава. Препринтова лінія — bioRxiv 2024.08.09.606917.

Як це потрапило в корпус

Первинне джерело в сесії — популярний переказ (допис у соцмережі українською). Ключові твердження звірені з публікацією PNAS і витримали звірку. Але датування й формулювання нижче беруться з статті, а не з переказу. Дві розбіжності переказу позначені в §IV.

I. Два геноми (E)

IY1DO
КультураДзьомон, рання фазаЯйой, середня фаза
Вік~8 200–8 300 р. т.~2 300 р. т.
Покриття~68×~47×
Матеріалкам’яниста частина скроневої кістки (найщільніша ділянка черепа)те саме
Спорідненістьпрактично відсутня з материковою Азією; тонка лінія до давнього індивіда з Корейського півостроваПівнічно-Східна Азія: Монгольське плато, Шаньдун

Покриття 68× і 47× — на порядок вище за типові давні зразки з Японії, де ґрунти погано зберігають ДНК. Саме це дало роздільність, недоступну раніше.

II. Дві демографічні траєкторії (E з застереженням)

  • Предки Дзьомон: чисельність невелика і стабільна протягом тисячоліть.
  • Предки Яйой: неухильне зростання.

Автори пояснюють контраст різницею способу життя й здобування їжі.

(Застереження: демографічні криві для окремих геномів будуються методами типу PSMC, що мають відомі обмеження на недавніх часових відрізках. Це не перепис населення.)

III. AMY1: адаптація до крохмалю до землеробства (E — головне)

НосійКопій AMY1
Дзьомон (IY1)~9
Яйой (DO)~10
Європейський мезолітичний мисливець-збирач La Braña 1~5
Неандертальці, денисівці2

Археологічний контекст пам’ятки Іяї (звідки IY1): жолуді, жолудеве борошно, волоські горіхи, каштани, сліди раннього окультурення квасолі адзукі.

Що це руйнує. Традиційне уявлення: зростання копійності AMY1 — пряма реакція на неолітичну революцію й перехід до зернового землеробства. Дев’ять копій у мисливця-збирача за тисячоліття до заливного рисівництва це спростовують: адаптація склалася на інтенсивному збиральництві горіхів, каштанів і коренеплодів.

Що це дає нашій рамці. Це другий незалежний випадок для розрізняльника §IV.3 ноти Zustrichna_koevolyutsiia_lyudyny_i_sviiskykh_tvaryn:

Індукція передбачає появу ознаки слідом за практикою. Відбір передбачає, що ознака вже є, і практика лише піднімає її частоту.

Тут ознака стоїть раніше за практику на тисячоліття. Отже рис не «спричинив» амілазу — він застав її готовою. Це також знімає AMY1 зі списку зустрічних змін під доместикацію (§III.3 тієї ноти, де він стояв як M-light кандидат): драйвером було збиральництво, не свійські рослини.

IV. Дві розбіжності популярного переказу (виправлено)

У переказіНасправді
IY1 жив «на самому початку періоду Дзьомон»~8.2 тис. р. т. — це ранній, а не початковий Дзьомон; початок доби — ~13–11 тис. до н.е.
Яйой «з 10 ст. до н.е.»Це переглянута радіовуглецева хронологія, і вона дискусійна; конвенційне датування початку Яйой — ~IV–III ст. до н.е. У ноті тримати обидві

V. Що це дає корпусу: «субстрат» треба розділити

У Etnohenez Yaponyy po fazam рядок таблиці зведений так: «Субстрат | до ~III в. | дзёмон/яёй». Це склеює дві різні за роллю величини. За формулою Kreolyzatsyonnyi_dvyhatel_etnoheneza:

Роль у двигуніХтоЧим підтверджено
Осілий автохтон (субстрат)Дзьомонглибока автохтонна лінія без материкового впливу; мала стабільна популяція; осілість без землеробства
Мобільний носій пакетаЯйойпівнічносхідноазійське походження; пакет = заливне рисівництво; зростаюча популяція
Продукт креолізаціїсучасне японське населенняобидві лінії присутні

Тобто японський випадок — підручниковий приклад роботи двигуна, а не фон перед ним. І це ставить питання про датування поштовху: сама нота позначає його як найспірніший пункт (III–VI ст., ядро Ямато). Якщо поштовх — це подія креолізації, він припадає на Яйой, а Ямато — вже інкубація/підйом.

Окремо цінне: Дзьомон — осілі мисливці-збирачі з керамікою (кераміка з 13–11 тис. до н.е., рання осілість, спеціалізована експлуатація ресурсів). Це рідкісний тип: горизонтальний полюс без землеробської основи, на відміну від Чатал-Гуюка і Трипілля. Контрольна точка для питання, чи горизонтальність потребує зерна.

Беремо / Адаптуємо / Не беремо

БеремоАдаптуємоНе беремо
Два геноми високого покриття; контраст спорідненості«дзьомон/яйой = субстрат» → Дзьомон субстрат, Яйой носій пакетасклеювання двох ролей в один рядок таблиці
AMY1 ~9 у Дзьомон проти ~5 у La Braña і 2 в архаїківAMY1 як другий тест розрізняльника відбір/індукціяAMY1 як приклад зустрічної зміни під доместикацію
Іяї: жолуді, жолудеве борошно, каштани, адзукіДзьомон як горизонталь без зерна — контрольна точка«на самому початку Дзьомон» (неточність переказу)
Демографічний контраст (мала стабільна vs зростаюча)питання про датування поштовху на Яйойдемографічні криві як точні цифри (метод PSMC-типу)

E/M-дисципліна

ТвердженняМітка
IY1 — ранній Дзьомон, ~8.2–8.3 тис. р. т., покриття ~68×E
DO — середній Яйой, ~2.3 тис. р. т., покриття ~47×E
Дзьомон майже без материкової спорідненості, тонка лінія до КореїE
Яйой близький до Монгольського плато й ШаньдунаE
AMY1: Дзьомон ~9, Яйой ~10, La Braña ~5, архаїки 2E
Адаптація до крохмалю передує рисівництвуE-висновок, прямо випливає з датувань
Демографічні траєкторії (мала стабільна vs зростаюча)E з методологічним застереженням; n = 2 геноми
Дзьомон = субстрат, Яйой = мобільний носій пакетаM (наша рамка) на E-даних
Поштовх японського етногенезу припадає на креолізацію ЯйойM (наша пропозиція) — суперечить нинішньому датуванню в ноті, потребує рішення
«Яйой з 10 ст. до н.е.»дискусійне — переглянута хронологія проти конвенційної

Open Questions

  • n = 2. Два геноми, хай і високого покриття, не дають популяційної статистики. Наскільки IY1 репрезентує Дзьомон загалом — з огляду на відому регіональну строкатість архіпелагу?
  • Тонка лінія IY1 до давнього індивіда з Корейського півострова — це слід глибокої спільної основи чи пізнішого контакту? Від цього залежить, наскільки Дзьомон «чистий» автохтон.
  • Чи був контакт Дзьомон–Яйой війною плюс шлюбом (зчеплена пара, Viina_i_shlyub_zcheplena_para_kanaliv), чи витісненням? Наявність обох ліній у сучасному населенні свідчить проти чистого витіснення — але потрібні дані про статеву асиметрію домішки, як у шнуровій.
  • Дзьомон як горизонталь без зерна: чи є в них сліди механізмів вирівнювання, порівнянні з квартальними асамблеями Трипілля, чи мала стабільна популяція знімає саму задачу?
  • Чи не є висока копійність AMY1 у Дзьомон успадкованою з ще давнішого східноєвразійського тла, а не набутою на жолудях? Це перевірка того самого розрізняльника на рівень глибше.

Зв’язки

Внутрішні

Зовнішні

  • Ishiya K. et al. High-coverage ancient genomes reveal divergent population histories and prehistoric starch-related genetic variation in Japan. — PNAS (2026). doi:10.1073/pnas.2606162123
  • Препринт: bioRxiv 2024.08.09.606917.
  • Cooke N. et al. — тричленна модель походження японців (Дзьомон + Яйой + Кофун), для контексту.